福建农林大学孙淑静教授团队对采自吉林省长白山、松山镇、黄松甸镇和漫江镇的34份野生猴头菇菌株及1份主栽菌株进行全基因组重测序，平均深度57.91X，获得51,236个SNP和4,957个InDel位点。群体遗传分析表明人工选育导致栽培菌株与野生群体显著遗传隔离（Fst=0.0798–0.0904），菌株聚类呈显著地理相关性；黄松甸镇群体核苷酸多样性最高（π=0.233），遗传资源尤为丰富。研究首次构建了长白山生态区猴头菇SNP与InDel变异数据库，为种质资源保护、核心种质筛选及分子育种提供了关键数据支撑